
Nature Protocols
Nature Protocols 是《Nature》旗下的高影响力期刊平台,发布详尽、可重复的实验操作流程,为生命科学与化学研究人员提供权威和可操作性强的实验指南。
Sequence Read Archive(SRA)是由美国国家生物技术信息中心(NCBI)维护的公共数据库,专门用于存储下一代测序(NGS)生成的原始读数数据。SRA 包含了全世界科研人员提交的测序项目数据,其内容涵盖了基因组测序、转录组测序(RNA-Seq)、外显子组测序、单细胞测序、表观遗传学等多个领域。SRA 支持的数据类型包括 Illumina、PacBio、Nanopore 等各种测序平台生成的数据。
使用 SRA,用户可以在统一的平台下高效地查询、下载和再利用海量的原始测序数据。平台支持通过关键词、项目名称、样本信息、生物体种类、实验方法等多维度进行检索,大大提高了数据的可发现性与可访问性。此外,SRA 与 NCBI 的其他数据库(如GEO、BioProject、BioSample等)高度整合,帮助研究者获取数据的上下文信息,提升数据的可重用性和科学价值。
SRA 还提供了一系列工具和 API 接口,研究人员可以通过 SRA Toolkit 或命令行方式进行程序化访问和批量下载,使得大规模数据分析更加便捷。借助人工智能和大数据分析的进步,SRA 正成为全世界生命科学研究人员进行基因组探索和疾病机制研究的重要资源库。