
TCGA
TCGA(癌症基因组图谱)是一个由美国国立癌症研究所(NCI)和国家人类基因组研究所(NHGRI)联合主导的大规模癌症基因组测序计划,致力于系统描绘多种癌症的基因突变图谱,为肿瘤研究和个性化治疗提供基础数据支撑。
HCCDB(The HCC gene expression Database)整合了来自14个公共转录组数据集的肝细胞癌样本数据,涵盖超过1,000例 HCC 患者的基因表达谱和组织类型注释。该数据库通过标准化的数据处理流程,使不同来源的数据可比性增强,为研究者提供一致、高质量的表达分析基础。
数据库提供强大的在线分析平台,用户可以进行差异表达分析、共表达网络分析、肿瘤与正常组织对比、分子亚型鉴定等常见功能分析任务。HCCDB 还集成了多个可视化功能,如热图、PCA、生存分析图和基因表达分布图等,使得结果直观易懂,便于数据解读和发表。
总的来说,HCCDB 为肝癌相关生物学研究提供了便捷的数据获取与分析服务,是进行肝癌机制探索、靶点发现和生物标志物研究的不二选择。研究人员无需具备复杂的编程能力,即可通过用户友好的网页界面完成多种分析任务,从而加速科研效率和结果产出。